EDI modullarining asosiy konfiguratsiyasi odatda uchta yo'nalish atrofida aylanadi: aloqa o'zaro muvofiqligi, ma'lumotlarni qayta ishlash va biznes hamkorligi. Bu turli korporativ tizimlar o'rtasida biznes ma'lumotlarining barqaror va aniq almashinuvini ta'minlaydi. Amalda, bu konfiguratsiyalar odatda integratsiya platformasi yoki o'rta dastur doirasida to'ldiriladi va turli hamkorlarning talablariga muvofiq moslashtiriladi.
Aloqa qatlami konfiguratsiyasi AS2, SFTP yoki VAN tarmoqlari kabi uzatish protokollaridan foydalanish kabi oʻzaro ishlash usuli va xavfsizlik parametrlarini oʻrnatishga qaratilgan. Shuningdek, u uzatish vaqtida maʼlumotlar xavfsizligi va yaxlitligini taʼminlash uchun identifikatsiya maʼlumotlarini (Hamkor ID), sertifikatlarni, shifrlash usullarini va har ikki muloqot qiluvchi tomonning imzo qoidalarini sozlashni talab qiladi. Bundan tashqari, xabar navbati sozlamalari, qayta urinish mexanizmlari va vaqt tugashi qoidalari ham uzatish ishonchliligini oshirish uchun foydalaniladigan ushbu bo'limga kiradi.
Ma'lumotlar va biznes konfiguratsiyasi asosan xabar turi ta'riflari, maydonlarni xaritalash qoidalari va formatni o'zgartirish qoidalarini o'z ichiga oladi. Ma'lumotlar tuzilmalari ko'pincha korxonalar o'rtasida farq qiladi, shuning uchun ichki tizim maydonlarini EDI standart maydonlariga solishtirish uchun xaritalash konfiguratsiyasi kerak. Biznesni ishga tushirish qoidalari, shuningdek, buyurtma yaratish, jo'natish bo'yicha fikr-mulohaza yoki muvofiqlashtirish davrlari kabi sozlangan, bu EDI ma'lumotlar almashinuvini muayyan biznes jarayonlariga kiritish imkonini beradi.